Создатели проекта Prototype 2 пролили свет на отличия РС-версии игры, выход которой задержится на три месяца, по сравнению с консольными. Отвечая на вопросы Mgnews, директор по дизайну Radical Entertainment Мэтт Армстронг (Matt Armstrong) сообщил, что причиной переноса выхода стало желание разработчиков провести более масштабные тестирования в области комбинаций различного железа и операционных систем.
Тем не менее, обладатели персональных компьютеров будут вознаграждены увеличенными техническими возможностями игры.

«РС-версия Prototype 2 будет поддерживать более высокое разрешение, увеличенный радиус прорисовки объектов, увеличенное число объектов на экране и улучшенные опции антиалиасинга».

Кроме того, РС-геймерам достанется весь контент из консольного издания Radnet Edition, что также станет дополнительным плюсом.

Выход игры запланирован на 24 апреля 2012 года для консолей и на 24 июля 2012 года для РС.